Zwischen 1997 und 2006 war Manuela Deseive bei zwei Personaldienstleistern beschäftigt. Während dieser Zeit arbeitete sie als Bereichsleiterassistentin bei EADS (European Aeronautic Defence and Space Company) im Bereich der LFK Lenkflugkörpersystem GmbH, anschließend als Sachbearbeiterin und Assistentin der Raumfahrttechnik bei CAM (Computeranwendungen für Management). 2004 kam sie schließlich zu Knorr-Bremse. Manuela Deseive war dort zunächst als Teamassistentin im Indirekten Einkauf tätig. 2006 wurde sie von Knorr-Bremse fest übernommen. Sie entwickelte sich von der Teamassistenz zur Einkäuferin und wechselte später ins Facility Management des Unternehmens.

Seit 2014 ist Manuela Deseive Mitglied des Betriebsrats der Knorr-Bremse Systeme für Schienenfahrzeuge GmbH, Knorr-Bremse AG und Knorr-Bremse Services GmbH in München. Sie engagiert sich darüber hinaus als Gewerkschaftsmitglied im Frauenortsauschuss der IG Metall in München.

Im Jahr 2021 wurde Manuela Deseive in den Aufsichtsrat der Knorr-Bremse Systeme für Schienenfahrzeuge gewählt. Seit 1. Januar 2025 ist sie zudem Mitglied des Aufsichtsrats der Knorr-Bremse AG.